Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTGFP29279 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTGFP29279 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTGFP29279 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTGFP29279 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTGFP29279 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTGFP29279 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTGFP29279 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTGFP29279 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTGFP29279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTGFP29279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTGFP29279 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTGFP29279 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTGFP29279 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTGFP29279 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CTGFP29279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTGFP29279 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms