Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HTR2AP28223 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms