Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPA1P27694 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPA1P27694 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RPA1P27694 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPA1P27694 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPA1P27694 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPA1P27694 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPA1P27694 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPA1P27694 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPA1P27694 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPA1P27694 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms