Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRGP23470 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRGP23470 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRGP23470 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
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