Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HRCP23327 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HRCP23327 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
HRCP23327 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
HRCP23327 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HRCP23327 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HRCP23327 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
HRCP23327 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
HRCP23327 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HRCP23327 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HRCP23327 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HRCP23327 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HRCP23327 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HRCP23327 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HRCP23327 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HRCP23327 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HRCP23327 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HRCP23327 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HRCP23327 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HRCP23327 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HRCP23327 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HRCP23327 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HRCP23327 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HRCP23327 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HRCP23327 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HRCP23327 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HRCP23327 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HRCP23327 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HRCP23327 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms