Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC3P19447 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC3P19447 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC3P19447 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms