Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT4P19013 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT4P19013 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT4P19013 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT4P19013 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT4P19013 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT4P19013 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT4P19013 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT4P19013 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT4P19013 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT4P19013 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT4P19013 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT4P19013 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT4P19013 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT4P19013 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT4P19013 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms