Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYN1P17600 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYN1P17600 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYN1P17600 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYN1P17600 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYN1P17600 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYN1P17600 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYN1P17600 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYN1P17600 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYN1P17600 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYN1P17600 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYN1P17600 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYN1P17600 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYN1P17600 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYN1P17600 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYN1P17600 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYN1P17600 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYN1P17600 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms