Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME1P15531 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME1P15531 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME1P15531 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME1P15531 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME1P15531 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME1P15531 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME1P15531 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME1P15531 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms