Protein–RNA interactions for Protein: P15421

GYPE, Glycophorin-E, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPEP15421 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GYPEP15421 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GYPEP15421 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GYPEP15421 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms