Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LAMC1P11047 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LAMC1P11047 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LAMC1P11047 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms