Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALM3P0DP25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms