Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR29P0C7W0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR29P0C7W0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms