Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UQCRFS1P1P0C7P4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UQCRFS1P1P0C7P4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms