Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLA1P09884 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLA1P09884 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLA1P09884 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
POLA1P09884 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
POLA1P09884 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLA1P09884 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLA1P09884 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLA1P09884 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
POLA1P09884 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLA1P09884 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLA1P09884 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
POLA1P09884 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLA1P09884 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLA1P09884 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLA1P09884 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLA1P09884 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
POLA1P09884 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLA1P09884 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLA1P09884 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLA1P09884 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLA1P09884 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLA1P09884 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLA1P09884 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
POLA1P09884 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
POLA1P09884 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
POLA1P09884 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
POLA1P09884 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
POLA1P09884 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
POLA1P09884 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
POLA1P09884 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
POLA1P09884 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
POLA1P09884 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
POLA1P09884 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
POLA1P09884 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
POLA1P09884 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
POLA1P09884 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
POLA1P09884 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
POLA1P09884 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
POLA1P09884 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
POLA1P09884 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
POLA1P09884 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
POLA1P09884 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
POLA1P09884 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
POLA1P09884 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
POLA1P09884 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
POLA1P09884 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
POLA1P09884 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
POLA1P09884 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLA1P09884 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLA1P09884 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLA1P09884 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLA1P09884 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLA1P09884 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
POLA1P09884 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
POLA1P09884 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
POLA1P09884 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
POLA1P09884 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms