Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCGP05129 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCGP05129 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCGP05129 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms