Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGAP02671 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGAP02671 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGAP02671 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGAP02671 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGAP02671 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGAP02671 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGAP02671 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGAP02671 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FGAP02671 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGAP02671 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGAP02671 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGAP02671 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGAP02671 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGAP02671 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGAP02671 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGAP02671 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGAP02671 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGAP02671 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGAP02671 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGAP02671 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGAP02671 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGAP02671 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGAP02671 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FGAP02671 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGAP02671 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGAP02671 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGAP02671 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms