Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNAP02545 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNAP02545 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNAP02545 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNAP02545 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNAP02545 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNAP02545 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNAP02545 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNAP02545 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMNAP02545 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms