Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TSPAN13O95857 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSPAN13O95857 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TSPAN13O95857 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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