Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM63AO94886 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms