Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKAP2O75563 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKAP2O75563 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms