Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BANF1O75531 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF1O75531 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF1O75531 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BANF1O75531 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF1O75531 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF1O75531 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF1O75531 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF1O75531 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF1O75531 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms