Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA2O75334 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA2O75334 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms