Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNT1O60563 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNT1O60563 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms