Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA5O60264 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA5O60264 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms