Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX15O60248 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOX15O60248 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX15O60248 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX15O60248 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX15O60248 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX15O60248 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX15O60248 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX15O60248 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms