Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HTATSF1O43719 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1O43719 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTATSF1O43719 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms