Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FANCAO15360 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FANCAO15360 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.79■■■■□ 3
FANCAO15360 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FANCAO15360 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FANCAO15360 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FANCAO15360 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FANCAO15360 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FANCAO15360 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCAO15360 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCAO15360 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCAO15360 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
FANCAO15360 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCAO15360 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FANCAO15360 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FANCAO15360 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FANCAO15360 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FANCAO15360 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCAO15360 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCAO15360 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCAO15360 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCAO15360 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCAO15360 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCAO15360 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCAO15360 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCAO15360 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCAO15360 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FANCAO15360 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FANCAO15360 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FANCAO15360 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FANCAO15360 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FANCAO15360 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
FANCAO15360 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms