Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHADO15335 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHADO15335 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHADO15335 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHADO15335 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHADO15335 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHADO15335 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHADO15335 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHADO15335 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHADO15335 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHADO15335 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHADO15335 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHADO15335 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHADO15335 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHADO15335 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms