Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPHP1O15259 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPHP1O15259 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms