Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TXNDC9O14530 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TXNDC9O14530 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms