Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9IYK1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9IYK1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C9IYK1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9IYK1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9IYK1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C9IYK1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C9IYK1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C9IYK1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C9IYK1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9IYK1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9IYK1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9IYK1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9IYK1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9IYK1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9IYK1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9IYK1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C9IYK1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9IYK1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9IYK1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9IYK1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9IYK1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9IYK1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9IYK1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9IYK1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9IYK1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms