Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEURL1BA8MQ27 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms