Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPOPA6NHQ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPOPA6NHQ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPOPA6NHQ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms