Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49BA6NDI0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM49BA6NDI0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms