Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRAMEF22A3QJZ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms