Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 DEFA8P-201ENST00000457582 285 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NIPSNAP2O75323 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms