Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRJQ12913 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AC023509.4-201ENST00000602306 775 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRJQ12913 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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