Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 C6orf163-203ENST00000608326 2110 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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LMO3Q8TAP4 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LMO3Q8TAP4 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LMO3Q8TAP4 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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LMO3Q8TAP4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC068987.3-201ENST00000637934 1195 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LMO3Q8TAP4 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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