Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-205ENST00000393881 1598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 POPDC2-204ENST00000468801 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC011458.2-201ENST00000603937 207 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 JAML-201ENST00000292067 1959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HRH2-201ENST00000231683 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RN7SKP218-201ENST00000410222 292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL139156.2-201ENST00000414059 340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC099344.2-201ENST00000430897 1061 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC022447.7-201ENST00000509629 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 BIN3-210ENST00000522268 321 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC005746.1-202ENST00000585495 716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms