Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN8AQ9UQD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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