Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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