Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM35Q9UPQ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM35Q9UPQ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms