Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR2

DDX19B, ATP-dependent RNA helicase DDX19B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX19BQ9UMR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX19BQ9UMR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX19BQ9UMR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX19BQ9UMR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms