Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP45Q9UL16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP45Q9UL16 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP45Q9UL16 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms