Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCTPQ9UKL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCTPQ9UKL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms