Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CROTQ9UKG9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms