Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTBP2Q9UKA9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTBP2Q9UKA9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms