Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBE1Q9UJT0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms