Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA4Q9UI42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA4Q9UI42 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms